От заражения до появления первых признаков заболевания (инкубационный период) проходит в среднем 7—9 сут. В течении болезни различают три периода: катаральный, спазматический и период разрешения. Катаральный период характеризуется появлением нетипичного сухого кашля, насморка, иногда — небольшого повышения температуры (в некоторых случаях температура поднимается до 38,5—39 °С). В последующие дни кашель постепенно усиливается, и через 10—14 сут болезнь вступает в спазматический период, когда кашель приобретает приступообразный характер. Приступы состоят из ряда коротких, быстро следующих друг за другом кашлевых толчков, сменяющихся свистящим судорожным вдохом. Приступ заканчивается выделением вязкой прозрачной мокроты, а нередко — рвотой. Лицо больного становится одутловатым, иногда отмечаются кровоизлияния в кожу, конъюнктиву глаз, в толщу век. В спазматическом периоде возникают изменения в органах дыхания (вздутие легких, поражение бронхов), в сердечно-сосудистой и нервной системах (повышение кровяного давления, повышенная возбудимость, раздражительность ребёнка), составе периферической крови. Продолжительность спазматического периода — 2—8 недель и больше. Затем наступает период разрешения, приступы кашля становятся реже и слабее, кашель постепенно прекращается. Осложнения а чаще наблюдаются у детей раннего возраста (пневмонии с затяжным течением; поражения нервной системы — энцефалопатии; возможны парезы черепномозговых нервов, потеря слуха, речи, зрения и др.).